Uitgeverij Euprint (Heverlee, België) is momenteel het meest actief met nieuwe uitgaven van Van Nuffel. Zij gaven reeds verschillende werken uit:
• JJ2: Jesu, dulcis memoria
• JJ3: Ego sum panis vitae
• JJ4: Qui manducat me
• JJ6: O quam suavis est
• JJ10: Tantum ergo in Es
• JJ12: O Sacrum convivium
• JJ70: Veni sponsa Christi
• JJ95: Inclina, Domine
• JJ107: Te Deum in c
• JJ127: Oudvlaamsche Kerstliederen

De meeste muziek van Van Nuffel die tijdens zijn leven uitgegeven is, zat bij uitgever Schwann in Düsseldorf. Zij maken momenteel enkel nog telefoonboeken. Een deel van de uitgaven is overgenomen door Edition Peters:
• JJ39: Ave Maria
• JJ76: Christus Vincit (gemengd koor)
• JJ75: Christus Vincit (herenkoor)
• JJ98: In convertendo Dominus
• JJ93: Missa in honorem Sancti Josephi
• JJ91: Missa in honorem SS. Cordis Jesu
• JJ56: O radix Jesse
• JJ77: Pater noster
• JJ97: Super flumina Babylonis

Enkele van die uitgaven zijn ook opgenomen in bundels bij Carus Verlag in Stuttgart, naast enkele nieuwe uitgaven:
• JJ39: Ave Maria
• JJ56: O radix Jesse
• JJ102: Dominus regnavit
• JJ127: Een kint gheboren in Bethlehem
• JJ127: Nu sijt willecome

De Vlaamse koorfederatie Koor&Stem bracht samen met uitgeverij Höflich (München) de bundel 'Romantic Choral Music from Flanders' uit. In deze bundel zijn drie werken opgenomen:
• JJ40: Sub tuum praesidium
• JJ47: Sicut Cedrus
• JJ39: Ave Maria